В эпоху, когда эмпирические науки – когнитивная психология, искусственный интеллект, нейроэтика – все более вторгаются на территорию, оставшуюся за философией после кантовского «коперниканского переворота», возникает закономерный вопрос: не становится ли философия как таковая лишь единицей хранения исторического архива человечества и частью кругозора «культурного человека», не оказывая более влияния на актуальные поиски истины? В статье через частичный пересмотр расхожих представлений о структуре научного знания определяется законная сфера применения профессиональных компетенций философов. Сначала приводятся аргументы, демонстрирующие несостоятельность возможных претензий философии на независимое от науки описание мира. Затем в ходе анализа структуры научного знания выделяется ранее в целом игнорируемый элемент – научные онтологии, или концептуальные схемы. Утверждается логическая независимость научных онтологий от теоретического и эмпирического компонентов науки. Выбор той или иной онтологии рассматривается как свободный выбор и творческий акт ученого, влияющий на конкурентные преимущества предлагаемой теории. Анализ и критика научных онтологий предлагается в качестве легитимной сферы приложения философских компетенций, наряду с метаонтологией – нормативной дисциплиной, трактующей возможности и правила построения предметных онтологий.